Гибридные версии коронавируса, сочетающие гены вариантов Delta и Omicron – неофициальное заглавие “Deltacron” – были выявлены по наименьшей мере у 17 пациентов в США и Европе. До сего времени Глобальная организация здравоохранения (ВОЗ) считала, что Дельтакрон был результатом загрязнения во время секвенирования. Не так давно вирусологи из IHU Méditerranée Infection в Марселе подтвердили его существование. Таковым образом, наиболее чем через два месяца опосля его открытия ВОЗ также признала его рекомбинантным вирусом. Но вирус расслабленно циркулирует с января и, похоже, не очень волнует профессионалов. Для доказательства первых наблюдений нужны последующие исследования.
Несколько вариантов SARS-CoV-2 поочередно либо сразу распространились по всему миру с лета 2020 года. Говорилось о неких коинфекциях с разными вариациями, также о генетической рекомбинации, всераспространенной посреди коронавирусов, о которой говорилось либо подозревалось на основании совместного обнаружения мутаций разных вариантов в данном геноме.
Дельтакрон, по-видимому, является вариантом SARS-CoV-2, содержащим элементы как Дельты, так и Омикрона. Иными словами, он содержит гены обоих вариантов, что делает его так именуемым рекомбинантным вирусом.
Перспектива возникновения в данной пандемии варианта, сочетающего внутри себя два самых массивных на нынешний денек варианта коронавируса, может показаться пугающей, в особенности беря во внимание, что Дельта была наиболее тяжеленной, чем остальные варианты, а Омикрон — весьма заразительной. Но какова действительность? Ученые из IHU Méditerranée Infection в Марселе (Франция) по заказу правительства выпустили отчет о собственном исследовании во вторник на сервере medRxiv. Они предоставляют достоверные данные о его существовании, опосля неверной волнения, спровоцированной исследователями из Института Кипра. Так, крайние утверждали, что в январе отыскали гибридный вариант, который оказался продуктом загрязнения меж эталонами во время секвенирования.
Команда Филиппа Колсона обрисовала и подтвердила при помощи секвенирования генома 3-х пациентов во Франции, инфицированных версией SARS-CoV-2, в какой S-белок (spike) варианта Омикрон смешивается с “телом” варианта Дельта. Остальные команды сказали о 12 остальных инфекциях Дельтакрона в Европе с января — все с S-белоком Омикрон и телом Дельта. Колсон гласит: “Во время пандемии SARS-CoV-2 два либо наиболее варианта циркулировали в одни и те же периоды времени и в одних и тех же географических районах. Это сделало способности для рекомбинации меж этими 2-мя вариациями”.
Понятно, что генетическая рекомбинация коронавирусов человека происходит, когда два варианта заражают и реплицируются у 1-го и такого же человека, в одних и тех же клеточках владельца. Потом они обмениваются генетическим материалом. Огромное количество частиц коронавируса снутри инфицированного человека, непременно, включают мутантов, которые могут оказаться первыми копиями вариантов. Эти разные вирусы составляют разную долю от полного количества.
Так, в исследовании, размещенном во вторник, 8 марта, в журнальчике The Journal of Clinical Investigation, приводятся данные о 5 испанских пациентах с COVID, вполне привитых от зараз, связанных с вариантом Альфа — который охватил Англию в конце 2020 года – с признаками вариантов Дельта Плюс и Омикрон. Селия Пералес из Мадридского автономного института и соавтор исследования разъясняет: “Вирус, который реплицируется в организме всякого инфицированного пациента, по сути представляет собой смесь незначительно различающихся вирусов SARS-CoV-2. Минорные варианты у 1-го инфицированного индивида могут стать доминирующими у другого, или случаем, или в итоге селективного достоинства, связанного с наличием либо отсутствием фармацевтических средств, вакцин либо остальных причин”.
Меж тем, Gisaid, глобальное общество ученых, обменивающихся информацией о вирусах, сказало, что 1-ые убедительные подтверждения существования этого гибридного варианта были предоставлены Институтом Пастера во Франции. Так, во вторник 8 марта вирусологи занесли в базу данных полную геномную последовательность рекомбинантного вируса AY.4/BA.1, подтвердив его окончательную структуру, возникшую в итоге рекомбинации меж вариантом Дельта (AY.4 либо одна из суб-линий) и Омикрон BA.1. Доктор Этьен Симон-Лориер из Института Пастера предупредил, что может существовать несколько разных рекомбинантных вирусов, образованных из Дельты и Омикрона.
Филипп Колсон добавил: “Вирус, который мы смотрим во Франции и Дании/Нидерландах, смотрится весьма похоже и быть может этим же рекомбинантом (с теми же родительскими вирусами), который путешествовал. Но вероятные рекомбинанты Дельта-Омикрон, о которых говорилось в таковых странах, как Англия и США, по-видимому, соединяют внутри себя разные части родительских вирусов и потому различаются от Дельтакрона, найденного во Франции”.
Сейчас в США и Европе было выявлено 17 подтвержденных случаев рекомбинантного вируса, в том числе три пациента во Франции, инфицированные данной гибридной версией SARS-CoV-2. Согласно неопубликованному отчету генетической исследовательской компании Helix, представленному medRxiv, в США были выявлены две остальные инфекции рекомбинантным, но не связанным с дельтакроном, вирусом. Статья обязана быть рецензирована и испытана.
Так как в текущее время выявлено только маленькое число случаев заболевания дельтакроном, пока нет достаточных данных о тяжести этого варианта и о том, как вакцины защищают от него. Наиболее того, обыденные ПЦР-тесты не могут найти этот гибрид.
Так как в текущее время выявлено только маленькое число случаев заболевания дельтакроном, пока нет достаточных данных о тяжести этого варианта и о том, как вакцины защищают от него. Наиболее того, обыденные ПЦР-тесты не могут найти этот гибрид. Потому в исследовании Филиппа Колсона и др. вирусологи разработали и применили дуплексную ПЦР, специфичную для гибридного варианта. Потом структурный анализ рекомбинантного спайк белка дозволил представить, что его гибридное содержание может улучшить связывание вируса с мембраной клетки-хозяина. Иными словами, заражать людей будет легче. Эти результаты призывают к предстоящим исследованиям вирусологических, эпидемиологических и клинических черт этого рекомбинанта.
Но в текущее время европейское население имеет значимый иммунитет к вариантам Дельта и Омикрон, как благодаря вакцинации, так и из-за высочайшего уровня циркуляции варианта Омикрон в крайние месяцы. Спайк-белок — самая принципиальная часть вируса, когда идет речь о вторжении в клеточки, и мишень для антител — происходит из Омикрон. Доктор Саймон-Лориер разъясняет: “Поверхность вирусов весьма похожа на поверхность Омикрон, потому организм распознает его так же, как и Омикрон. Потому сейчас нет обстоятельств волноваться о возникновении этого новейшего варианта”.
Тем не наименее Колсон предупреждает: “Мы должны смотреть за поведением этого рекомбинанта исходя из убеждений трансмиссивности и возможности избежать иммунной защиты, вызванной вакциной. Это также свидетельствует о необходимости неизменного генетического наблюдения. Так как вирус продолжает циркулировать, в особенности в недостаточно вакцинированных группах населения и посреди людей с ослабленным иммунитетом, мы, быстрее всего, увидим больше вариантов, включая те, которые появились в итоге рекомбинации.”.
В сегодняшних критериях ВОЗ обеспокоена тем, что почти все страны резко уменьшают объемы тестирования, также ограничительные меры. На самом деле, это препятствует способности выслеживать вирус, то, как он распространяется и как развивается. Тестирование остается принципиальным инвентарем в борьбе с пандемией, являясь частью глобальной стратегии.
Потому угроза возникновения новейших вариантов не вызывает колебаний. Как заявил несколько недель вспять генеральный директор ВОЗ, риск возникновения новейших, наиболее трансмиссивных и смертельно небезопасных вариантов “весьма реален”. Необходимо подчеркнуть, что для обнаружения рекомбинации в вирусах были разработаны спец способы. Таковым образом, исследования скорости рекомбинации SARS-CoV-2 дозволят сопоставить его с иными вирусами (РНК либо нет), чтоб лучше осознать вирус и предвидеть, какие новейшие варианты либо композиции мутаций могут показаться.
Источник
Читайте далее:
